Лаборатория генной инженерии
- Поиск и исследование новых антикоагулянтов медицинской пиявки (Hirudo medicinalis). Используя современные биотехнологические подходы, мы идентифицировали 10 новых потенциальных антикоагулянтов из расшифрованного генома пиявки, в ходе дальнейших исследований мы получили и исследовали новый перспективный антикоагулянт (цистеин-богатый антикоагулянт медицинской пиявки), превосходящий по активности гирудин. В настоящее время лаборатория работает над получением рекомбинантных цистеин-богатых антикоагулянтов, найденных у других пиявок. Это направление открывает возможности для изучения механизма действия данного белка, а в дальнейшем создания более эффективных и безопасных альтернатив существующим антикоагулянтам с предсказуемым терапевтическим действием.
- Разработка инновационных антимикробных пептидов (АМП) с использованием комбинированного подхода: создание библиотек мутантных вариантов природных АМП методом случайного мутагенеза, высокопроизводительный селекционный отбор наиболее активных штаммов против целевых бактерий, компьютерное моделирование для выявления ключевых структурно-функциональных закономерностей. Цель проекта - создание нового поколения АМП с повышенной эффективностью и специфичностью действия против устойчивых патогенов.
- Оптимизация клеточной линии HEK293 для получения линии-продуцента рекомбинантных белков, культивируемой в минимальных питательных средах, путем CRISPR-Cas9 опосредованного усиления экспрессии генов ростовых факторов. С помощью системы синергичных медиаторов активации мы активируем экспрессию эндогенных ростовых факторов, что позволит: увеличить пролиферативную активность и продуктивность клеток, исключить использование эмбриональной телячьей сыворотки, снизить стоимость производства биопрепаратов.
- Генетическая модификация Escherichia coli для создания штаммов-продуцентов рекомбинантных белков и ДНК-векторов с пониженным содержанием эндотоксинов. Мы разрабатываем подходы по модификации структуры липополисахаридов (ЛПС) бактериальной клеточной стенки, чтобы либо устранить их пирогенные свойства, либо облегчить их удаление при очистке. Это позволит получать биопрепараты высокой чистоты без трудоемких многоступенчатых процедур очистки, что особенно важно для биофармацевтики и фундаментальных исследований.
- Еще одним направлением в лаборатории является создание рекомбинантных противоопухолевых препаратов. В частности, в настоящий момент времени ведётся работа по получению и проверке онколитической активности химерных апоптинов – небольших пролин-богатых белков вирусной природы, активирующих в опухолевых клетках апоптоз.
Основные направления исследований лаборатории
Лаборатория генной инженерии ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России была создана в 2004 году приказом академика Ю.М. Лопухина. С момента создания лабораторией руководит В.Н. Лазарев. В исследованиях используются методы биохимии, биофизики, молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии. Сочетание современного арсенала методов и глубокого понимания физико-химических основ биологических процессов позволяет проводить оригинальные научные исследования, результаты которых стали не только российскими, но и мировыми достижениями.
Научная биография
Родился в 1972 г. в г. Коломне Московской области, окончил ветеринарно-биологический факультет Московской ветеринарной академии им. К.И.Скрябина по специальности «биофизика» в 1994 г.
В 1998 г. защитил кандидатскую диссертацию по специальности «молекулярная биология» «Изучение биологической активности рибозимов, специфически расщепляющих мРНК гена PBI вируса гриппа А в культуре клеток» во Всероссийском НИИ сельскохозяйственной биотехнологии.
С 2004 г – заведующий лаборатории генной инженерии ФГБУН «НИИ физико-химической медицины ФМБА России».
В 2010 г. защитил докторскую диссертацию по специальности «молекулярная биология» «Новая стратегия использования генов антимикробных пептидов из яда членистоногих в качестве генотерапевтических агентов»
Под руководством Лазарева В.Н. защищено 7 диссертаций и более 20 дипломных работ студентами Московской академии ветеринарной медицины и биотехнологии, студентами Российского государственного медицинского университета им. Н.И.Пирогова, Московского физико-технического института.
В 1998 г. защитил кандидатскую диссертацию по специальности «молекулярная биология» «Изучение биологической активности рибозимов, специфически расщепляющих мРНК гена PBI вируса гриппа А в культуре клеток» во Всероссийском НИИ сельскохозяйственной биотехнологии.
С 2004 г – заведующий лаборатории генной инженерии ФГБУН «НИИ физико-химической медицины ФМБА России».
В 2010 г. защитил докторскую диссертацию по специальности «молекулярная биология» «Новая стратегия использования генов антимикробных пептидов из яда членистоногих в качестве генотерапевтических агентов»
Под руководством Лазарева В.Н. защищено 7 диссертаций и более 20 дипломных работ студентами Московской академии ветеринарной медицины и биотехнологии, студентами Российского государственного медицинского университета им. Н.И.Пирогова, Московского физико-технического института.
Доктор биологических наук
Доцент по специальности «молекулярная биология»
Заведующий лабораторией
Лазарев Василий Николаевич
E-mail: lazarev[at]rcpcm[dot]org
ORCID: 0000-0003-0042-966X
ResearcherID: A-8313-2014
Scopus: 57205513439
- генная терапия инфекционных заболеваний
- разработка оптимальных способов переноса и регулирования экспрессии искусственных генов
Научные интересы:
Преподавательская деятельность: профессор на кафедре молекулярной и трансляционной медицины Московского Физико-Технического Института (Национальный Исследовательский Университет)
Научная биография
В 2003 г. закончил биологический факультет МГУ им. Ломоносова (кафедра Молекулярной биологии).
В 2006 г. закончил аспирантуру ФГУП ГосНИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов.
С 2002 по 2011 г. работал в лаборатории молекулярной биологии ФГУП «ГосНИИ генетика», сперва инженером,
с 2007 г. – в должности младшего научного сотрудника., а с 2009 г. – научного сотрудника.
С 2011 г. – старший научный сотрудник лаборатории генной инженерии ФНКЦ ФХМ.
С 2021 – ведущий научный сотрудник лаборатории генной инженерии ФНКЦ ФХМ.
В 2006 г. закончил аспирантуру ФГУП ГосНИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов.
С 2002 по 2011 г. работал в лаборатории молекулярной биологии ФГУП «ГосНИИ генетика», сперва инженером,
с 2007 г. – в должности младшего научного сотрудника., а с 2009 г. – научного сотрудника.
С 2011 г. – старший научный сотрудник лаборатории генной инженерии ФНКЦ ФХМ.
С 2021 – ведущий научный сотрудник лаборатории генной инженерии ФНКЦ ФХМ.
Кандидат биологических наук
Доцент на кафедре молекулярной и трансляционной медицины МФТИ (НИУ)
Ведущий научный сотрудник
Манувера Валентин Александрович
ORCID: 0000-0002-2471-0563
Scopus: 23497936600
ResearcherID: F-8030-2017
Научная биография
В 2015 году закончила магистратуру МФТИ по направлению 03.04.01 «Прикладные математика и физика» (кафедра трансляционной медицины).
В 2019 году – аспирантуру МФТИ по направлению 1.5.4 «Биологические науки» (специальность «Биохимия»).
С 2012 года работает в лаборатории генной инженерии.
В 2019 году – аспирантуру МФТИ по направлению 1.5.4 «Биологические науки» (специальность «Биохимия»).
С 2012 года работает в лаборатории генной инженерии.
Кандидат биологических наук
Старший научный сотрудник
Графская Екатерина Николаевна
ORCID: 0000-0001-8957-6142
Scopus: 56663291300
ResearcherID: F-3434-2017
Научная биография
В 2003 году закончил биологический факультет МГУ им. М.В.Ломоносова (кафедра вирусологии).
В 2006 году закончил аспирантуру РОНЦ им. Н.Н.Блохина РАМН.
С 2007 по 2012 работал в лаборатории молекулярной биологии ФГУП «ГосНИИ генетика».
С 2012 по 2014 работал в лаборатории молекулярной инженерии Института биохимии им. А.Н.Баха РАН.
С 2014 по настоящее время работает старшим научным сотрудником в лаборатории генной инженерии ФНКЦ ФХМ им. Ю.М.Лопухина ФМБА РФ.
В 2006 году закончил аспирантуру РОНЦ им. Н.Н.Блохина РАМН.
С 2007 по 2012 работал в лаборатории молекулярной биологии ФГУП «ГосНИИ генетика».
С 2012 по 2014 работал в лаборатории молекулярной инженерии Института биохимии им. А.Н.Баха РАН.
С 2014 по настоящее время работает старшим научным сотрудником в лаборатории генной инженерии ФНКЦ ФХМ им. Ю.М.Лопухина ФМБА РФ.
Кандидат биологических наук
Старший научный сотрудник
Широков Дмитрий Алексеевич
ORCID: 0000-0001-6080-3348
Scopus: 39962568700
Научные интересы:
- онкогенные вирусы
- рекомбинантные противоопухолевые препараты
ResearcherID: C-9697-2014
Преподавательская деятельность: С 2011 года читает спецкурсы по молекулярной биологии вирусов студентам магистратуры ветеринарно-биологического факультета МГАВМиБ им. К.И.Скрябина
Научная биография
В 2006 г. закончила биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова (кафедра Молекулярной биологии).
В 2013 г. закончила аспирантуру ФНКЦ ФХМ ФМБА России по специальности «биохимия».
С 2009 г. работала в лаборатории генной инженерии в должности младшего научного сотрудника, с 2016 г. – научного сотрудника, а с 2021 г. – старшего научного сотрудника.
В 2013 г. закончила аспирантуру ФНКЦ ФХМ ФМБА России по специальности «биохимия».
С 2009 г. работала в лаборатории генной инженерии в должности младшего научного сотрудника, с 2016 г. – научного сотрудника, а с 2021 г. – старшего научного сотрудника.
Кандидат биологических наук
Старший научный сотрудник
Харлампиева Дарья Дмитриевна
ORCID: 0000-0002-3514-2303
Scopus: 37074734300
ResearcherID: F-3680-2017
Научная биография
В 2013 г. Закончил ФГАОУ ВО РНИМУ им Н.И. Пирогова МЗ РФ по специальности «медицинская биофизика», присвоена квалификация «Врач биофизик».
В 2016 г. – окончил аспирантуру ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по специальности «молекулярная биология».
С 2011 г. работал в лаборатории генной инженерии в должности лаборанта.
С 2013 г. –работал в должности младшего научного сотрудника, а с 2023 г. – в должности научного сотрудника лаборатории генной инженерии.
В 2016 г. – окончил аспирантуру ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России по специальности «молекулярная биология».
С 2011 г. работал в лаборатории генной инженерии в должности лаборанта.
С 2013 г. –работал в должности младшего научного сотрудника, а с 2023 г. – в должности научного сотрудника лаборатории генной инженерии.
Кандидат биологических наук
Доцент кафедры молекулярной и трансляционной медицины ФБМФ МФТИ
Научный сотрудник
Бобровский Павел Александрович
ORCID: 0000-0001-5735-0042
Scopus: 57188849623
ResearcherID: R-2069-2018
Научная биография
С 2019 года работает в лаборатории генной инженерии.
В 2022 году закончила специалитет МГУ по специальности 06.05.01 «Биоинженерия и биоинформатика».
В 2022 году закончила специалитет МГУ по специальности 06.05.01 «Биоинженерия и биоинформатика».
- Полина Надежда ФедоровнаНаучный сотрудник, кандидат биологических наук
Работает в лаборатории генной инженерии с 2007 года. - Бровина Ксения АлександровнаЛаборант, аспирант МФТИ (НИУ)
- Русавский Никита РуслановичЛаборант, cтудент 1 курса магистратуры ФБМФ МФТИ
Работает в лаборатории генной инженерии с 2025г - Семенченко Елизавета ДмитриевнаСтудент 1 курса магистратуры биологического факультета МГУ
- Лепехина Дарья ЮрьевнаЛаборант
С 2021 года работает в лаборатории генной инженерии.
В 2022 году закончила магистратуру МГАВМиБ-МВА им. К.И. Скрябина по направлению «Биология», профиль «Молекулярная биология и биофизика». - Алиева Сабина ЭлмировнаЛаборант-исследователь
В 2023 году закончила бакалавриат РТУ МИРЭА по специальности 19.03.01 «Биотехнология».
С 2023 года работает в лаборатории генной инженерии. - Бессонова Екатерина АдольфовнаЛаборант
В 1986 г. Окончила МФУ №10 по специальности
фармацевт.
С 1986 по 1990 гг. Работала в Аптеке №69 - фармацевтом,
потом зам. зав. отдела готовых форм.
С 1990 по 2011 гг. Работала в ФГБУ «Национальный
Медицинский Исследовательский Центр Кардиологии им.
Академика Е.И. Чазова» МЗРФ – старшим лаборантом в
лаборатории генной инженерии.
С 2011 по 2021 гг. Работала в ООО «Аллель» Центр
Инновационных Биотехнологий – старшим лаборантом. - Анисимова Вероника ЕвгеньевнаОкончила биологический факультет МГУ, кафедра биохимии.
Училась в аспирантуре ИБХ РАН.
Работала в ИБХ РАН, ООО 'Евроген', ОАО 'БиоИнтегратор'.
В лаборатории генной инженерии работает с 2024 года. - Розынька Вероника РомановнаСтудент 3 курса бакалавриата ФБМФ МФТИ по направлению Биотехнология
Избранные публикации в рецензируемых научных журналах
1) AN ESCHERICHIA COLI STRAIN FOR PLASMID DNA PRODUCTION WITH A LOW ENDOTOXIN LEVEL
Kharlampieva D.D., Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Lazarev V.N., Manuvera V.A.
Applied Biochemistry and Microbiology. 2024. Т. 60. № 6. С. 1147-1152.
2) NEW ANTICOAGULANT PROTEIN FROM MEDICINAL LEECH
Manuvera V.A., Kharlampieva D.D., Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Brovina K.A., Lazarev V.N.
Biochemical and Biophysical Research Communications. 2024. Т. 696. С. 149473.
3) SPECIFIC ACTIVATION OF THE EXPRESSION OF GROWTH FACTOR GENES IN EXPI293F HUMAN CELLS USING CRISPR/CAS9-SAM TECHNOLOGY INCREASES THEIR PROLIFERATION
Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Kharlampieva D.D., Manuvera V.A., Lazarev V.N.
Acta Naturae (англоязычная версия). 2024. Т. 16. № 3. С. 25-37.
4) МЕТОДИКА ОЦЕНКИ ВЛИЯНИЯ РАСТВОРОВ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ ВЕЩЕСТВ НА КОАГУЛЯЦИЮ
Манувера В.А., Бровина К.А., Бобровский П.А., Графская Е.Н., Харлампиева Д.Д., Лазарев В.Н.
Медицина экстремальных ситуаций. 2024. Т. 26. № 2. С. 120-124.
5) APPLICATION OF SEMI-QUANTITATIVE LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION FOR GENE EXPRESSION STUDY IN EXPI293 CELLS
Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Kharlampieva D.D., Fisunov G.Yu., Manuvera V.A., Lazarev V.N.
Genes & Cells. 2024. Т. 19. № 4. С. 425-440.
6) UPREGULATION OF YCIM EXPRESSION REDUCES ENDOTOXIN CONTAMINATION OF RECOMBINANT PROTEINS PRODUCED IN ESCHERICHIA COLI CELLS
Marin E., Kornilov D.A., Bukhdruker S.S., Aleksenko V.A., Manuvera V.A., Zinovev E.V., Kovalev K.V., Shevtsov M.B., Talyzina A.A., Bobrovsky P.A., Kuzmichev P.K., Mishin A.V., Gushchin I.Y., Lazarev V.N., Borshchevskiy V.I.
cientific Reports. 2023. Т. 13. № 1. С. 6641.
7) STRUCTURAL INSIGHTS INTO THROMBOLYTIC ACTIVITY OF DESTABILASE FROM MEDICINAL LEECH
Marin E., Kornilov D.A., Bukhdruker S.S., Aleksenko V.A., Manuvera V.A., Zinovev E.V., Kovalev K.V., Shevtsov M.B., Talyzina A.A., Bobrovsky P.A., Kuzmichev P.K., Mishin A.V., Gushchin I.Y., Lazarev V.N., Borshchevskiy V.I.
Scientific Reports. 2023. Т. 13. № 1. С. 6641.
8) ПРОСТАЯ МЕТОДИКА ВЫДЕЛЕНИЯ ПЛАЗМИД ИЗ ESCHERICHIA COLI ДЛЯ ЭФФЕКТИВНОЙ ХИМИЧЕСКОЙ ТРАНСФЕКЦИИ КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА
Манувера В.А., Графская Е.Н., Лазарев В.Н.
Biomedical Chemistry: Research and Methods. 2022. Т. 5. № 3. С. e00170.
9) NON-TOXIC ANTIMICROBIAL PEPTIDE HM-AMP2 FROM LEECH METAGENOME PROTEINS IDENTIFIED BY THE GRADIENT-BOOSTING APPROACH
Grafskaia E.N., Pavlova E.R., Latsis I.A., Malakhova M.V., Ivchenkov D.V., Bashkirov P.V., Kot E.F., Mineev K.S., Arseniev A.S., Klinov D.V., Lazarev V.N.
Materials & Design. 2022. Т. 224. С. 111364.
10) RECOMBINANT DESTABILASE FROM HIRUDO MEDICINALIS IS ABLE TO DISSOLVE HUMAN BLOOD CLOTS IN VITRO
Bobrovsky P., Manuvera V., Lazarev V., Baskova I., Nemirova S., Medvedev A.
Current Issues in Molecular Biology. 2021. Т. 43. № 3. С. 2068-2081.
11) ИНГИБИРОВАНИЕ ХЛАМИДИЙНОЙ ИНФЕКЦИИ ПУТЕМ CRISPR/CAS9-SAM ОПОСРЕДОВАННОГО УСИЛЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ПЕПТИДОГЛИКАН-РАСПОЗНАЮЩИХ БЕЛКОВ ЧЕЛОВЕКА В КЛЕТКАХ ЛИНИИ HELA
Бобровский П.А., Мороз В.Д., Лавренова В.Н., Манувера В.А., Лазарев В.Н.
Биохимия. 2020. Т. 85. № 11. С. 1540-1549.
12) Draft genome sequences of Hirudo medicinalis and salivary transcriptome of three closely related medicinal leeches
Babenko, V. V., Podgorny, O. V., Manuvera, V. A., Kasianov, A. S., Manolov, A. I., Grafskaia, E. N., Shirokov, D. A., Kurdyumov, A. S., Vinogradov, D. V., Nikitina, A. S., Kovalchuk, S. I., Anikanov, N. A., Butenko, I. O., Pobeguts, O. V., Matyushkina, D. S., Rakitina, D. V., Kostryukova, E. S., Zgoda, V. G., Baskova, I. P., … Lazarev, V. N.
BMC Genomics, 21(1), 331.
13) Generation of recombinant VP3 protein of infectious bursal disease virus in three different expression systems, antigenic analysis of the obtained polypeptides and development of an ELISA test
Shirokov, D. A., Manuvera, V. A., Miroshina, O. A., Dubovoi, A. S., Samuseva, G. N., Dmitrieva, M. E., & Lazarev, V. N.
Archives of virology, 2020, 165(7), 1611–1620.
14) Method for Analyzing the Antimicrobial Activity of Peptides via the Escherichia coli Expression System
E. N. Grafskaia, D. D. Kharlampieva, P. A. Bobrovsky, M. Y. Serebrennikova, V. N. Lazarev & V. A. Manuvera
Appl Biochem Microbiol 61, 76–83 (2025)
1) AN ESCHERICHIA COLI STRAIN FOR PLASMID DNA PRODUCTION WITH A LOW ENDOTOXIN LEVEL
Kharlampieva D.D., Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Lazarev V.N., Manuvera V.A.
Applied Biochemistry and Microbiology. 2024. Т. 60. № 6. С. 1147-1152.
2) NEW ANTICOAGULANT PROTEIN FROM MEDICINAL LEECH
Manuvera V.A., Kharlampieva D.D., Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Brovina K.A., Lazarev V.N.
Biochemical and Biophysical Research Communications. 2024. Т. 696. С. 149473.
3) SPECIFIC ACTIVATION OF THE EXPRESSION OF GROWTH FACTOR GENES IN EXPI293F HUMAN CELLS USING CRISPR/CAS9-SAM TECHNOLOGY INCREASES THEIR PROLIFERATION
Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Kharlampieva D.D., Manuvera V.A., Lazarev V.N.
Acta Naturae (англоязычная версия). 2024. Т. 16. № 3. С. 25-37.
4) МЕТОДИКА ОЦЕНКИ ВЛИЯНИЯ РАСТВОРОВ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫХ ВЕЩЕСТВ НА КОАГУЛЯЦИЮ
Манувера В.А., Бровина К.А., Бобровский П.А., Графская Е.Н., Харлампиева Д.Д., Лазарев В.Н.
Медицина экстремальных ситуаций. 2024. Т. 26. № 2. С. 120-124.
5) APPLICATION OF SEMI-QUANTITATIVE LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION FOR GENE EXPRESSION STUDY IN EXPI293 CELLS
Bobrovsky P.A., Grafskaia E.N., Kharlampieva D.D., Fisunov G.Yu., Manuvera V.A., Lazarev V.N.
Genes & Cells. 2024. Т. 19. № 4. С. 425-440.
6) UPREGULATION OF YCIM EXPRESSION REDUCES ENDOTOXIN CONTAMINATION OF RECOMBINANT PROTEINS PRODUCED IN ESCHERICHIA COLI CELLS
Marin E., Kornilov D.A., Bukhdruker S.S., Aleksenko V.A., Manuvera V.A., Zinovev E.V., Kovalev K.V., Shevtsov M.B., Talyzina A.A., Bobrovsky P.A., Kuzmichev P.K., Mishin A.V., Gushchin I.Y., Lazarev V.N., Borshchevskiy V.I.
cientific Reports. 2023. Т. 13. № 1. С. 6641.
7) STRUCTURAL INSIGHTS INTO THROMBOLYTIC ACTIVITY OF DESTABILASE FROM MEDICINAL LEECH
Marin E., Kornilov D.A., Bukhdruker S.S., Aleksenko V.A., Manuvera V.A., Zinovev E.V., Kovalev K.V., Shevtsov M.B., Talyzina A.A., Bobrovsky P.A., Kuzmichev P.K., Mishin A.V., Gushchin I.Y., Lazarev V.N., Borshchevskiy V.I.
Scientific Reports. 2023. Т. 13. № 1. С. 6641.
8) ПРОСТАЯ МЕТОДИКА ВЫДЕЛЕНИЯ ПЛАЗМИД ИЗ ESCHERICHIA COLI ДЛЯ ЭФФЕКТИВНОЙ ХИМИЧЕСКОЙ ТРАНСФЕКЦИИ КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА
Манувера В.А., Графская Е.Н., Лазарев В.Н.
Biomedical Chemistry: Research and Methods. 2022. Т. 5. № 3. С. e00170.
9) NON-TOXIC ANTIMICROBIAL PEPTIDE HM-AMP2 FROM LEECH METAGENOME PROTEINS IDENTIFIED BY THE GRADIENT-BOOSTING APPROACH
Grafskaia E.N., Pavlova E.R., Latsis I.A., Malakhova M.V., Ivchenkov D.V., Bashkirov P.V., Kot E.F., Mineev K.S., Arseniev A.S., Klinov D.V., Lazarev V.N.
Materials & Design. 2022. Т. 224. С. 111364.
10) RECOMBINANT DESTABILASE FROM HIRUDO MEDICINALIS IS ABLE TO DISSOLVE HUMAN BLOOD CLOTS IN VITRO
Bobrovsky P., Manuvera V., Lazarev V., Baskova I., Nemirova S., Medvedev A.
Current Issues in Molecular Biology. 2021. Т. 43. № 3. С. 2068-2081.
11) ИНГИБИРОВАНИЕ ХЛАМИДИЙНОЙ ИНФЕКЦИИ ПУТЕМ CRISPR/CAS9-SAM ОПОСРЕДОВАННОГО УСИЛЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ПЕПТИДОГЛИКАН-РАСПОЗНАЮЩИХ БЕЛКОВ ЧЕЛОВЕКА В КЛЕТКАХ ЛИНИИ HELA
Бобровский П.А., Мороз В.Д., Лавренова В.Н., Манувера В.А., Лазарев В.Н.
Биохимия. 2020. Т. 85. № 11. С. 1540-1549.
12) Draft genome sequences of Hirudo medicinalis and salivary transcriptome of three closely related medicinal leeches
Babenko, V. V., Podgorny, O. V., Manuvera, V. A., Kasianov, A. S., Manolov, A. I., Grafskaia, E. N., Shirokov, D. A., Kurdyumov, A. S., Vinogradov, D. V., Nikitina, A. S., Kovalchuk, S. I., Anikanov, N. A., Butenko, I. O., Pobeguts, O. V., Matyushkina, D. S., Rakitina, D. V., Kostryukova, E. S., Zgoda, V. G., Baskova, I. P., … Lazarev, V. N.
BMC Genomics, 21(1), 331.
13) Generation of recombinant VP3 protein of infectious bursal disease virus in three different expression systems, antigenic analysis of the obtained polypeptides and development of an ELISA test
Shirokov, D. A., Manuvera, V. A., Miroshina, O. A., Dubovoi, A. S., Samuseva, G. N., Dmitrieva, M. E., & Lazarev, V. N.
Archives of virology, 2020, 165(7), 1611–1620.
14) Method for Analyzing the Antimicrobial Activity of Peptides via the Escherichia coli Expression System
E. N. Grafskaia, D. D. Kharlampieva, P. A. Bobrovsky, M. Y. Serebrennikova, V. N. Lazarev & V. A. Manuvera
Appl Biochem Microbiol 61, 76–83 (2025)
Диссертационные исследования, проведенные и подготовленные к защите в лаборатории генной инженерии
1) Изучение генетического полиморфизма и экспрессия в Escherichia coli стерол-14a-деметилазы Mycobacterium tuberculosis
Шавкунов Александр Сергеевич
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2003)
2) Клонирование и экспрессия генов, кодирующих белки мембраны включения IncA-IncG Chlamydia trachomatis
Кострюкова Елена Сергеевна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальностям 03.01.04 – биохимия, 03.01.03 – молекулярная биология (2007)
3) Структурно-функциональная характеристика белков мембраны включения Chlamydia trachomatis
Басовский Юрий Иванович
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальностям 03.01.04 – биохимия, 03.01.03 – молекулярная биология (2008)
4) Новая стратегия использования генов антимикробных пептидов из яда членистоногих в качестве генотерапевтических агентов
Лазарев Василий Николаевич
Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальности 03.01.03 – молекулярная биология (2010)
5) Биологическая активность антимикробных пептидов из яда паука Lachesana tarabaevi на модели инфекции Chlamydia trachomatis
Полина Надежда Федоровна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2016)
6) Получение рекомбинантных фрагилизинов Bacteroides fragilis и исследование их биологической активности
Харлампиева Дарья Дмитриевна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2016)
7) Получение и свойства рекомбинантной дестабилазы - полифункционального фермента медицинской пиявки
Курдюмов Алексей Сергеевич
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2017)
8) Антимикробные пептиды секрета слюнных клеток медицинской пиявки Hirudo medicinalis
Графская Екатерина Николаевна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2021)
9) Разработка репортерных систем в клетках Helicobacter pylori для создания модели микрофлюидного биосенсора
Белова Александра Михайловна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.03 – молекулярная биология (2022)
10) Исследование антихламидийной активности пептидогликан-распознающих белков человека
Бобровский Павел Александрович
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.3. Молекулярная биология (2023)
1) Изучение генетического полиморфизма и экспрессия в Escherichia coli стерол-14a-деметилазы Mycobacterium tuberculosis
Шавкунов Александр Сергеевич
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2003)
2) Клонирование и экспрессия генов, кодирующих белки мембраны включения IncA-IncG Chlamydia trachomatis
Кострюкова Елена Сергеевна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальностям 03.01.04 – биохимия, 03.01.03 – молекулярная биология (2007)
3) Структурно-функциональная характеристика белков мембраны включения Chlamydia trachomatis
Басовский Юрий Иванович
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальностям 03.01.04 – биохимия, 03.01.03 – молекулярная биология (2008)
4) Новая стратегия использования генов антимикробных пептидов из яда членистоногих в качестве генотерапевтических агентов
Лазарев Василий Николаевич
Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальности 03.01.03 – молекулярная биология (2010)
5) Биологическая активность антимикробных пептидов из яда паука Lachesana tarabaevi на модели инфекции Chlamydia trachomatis
Полина Надежда Федоровна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2016)
6) Получение рекомбинантных фрагилизинов Bacteroides fragilis и исследование их биологической активности
Харлампиева Дарья Дмитриевна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2016)
7) Получение и свойства рекомбинантной дестабилазы - полифункционального фермента медицинской пиявки
Курдюмов Алексей Сергеевич
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2017)
8) Антимикробные пептиды секрета слюнных клеток медицинской пиявки Hirudo medicinalis
Графская Екатерина Николаевна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.04 – биохимия (2021)
9) Разработка репортерных систем в клетках Helicobacter pylori для создания модели микрофлюидного биосенсора
Белова Александра Михайловна
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.01.03 – молекулярная биология (2022)
10) Исследование антихламидийной активности пептидогликан-распознающих белков человека
Бобровский Павел Александрович
Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.3. Молекулярная биология (2023)
Выполняются диссертационные работы
1) Дизайн новых антимикробных пептидов и анализ их структурно-функциональных свойств
Серебренникова Мария Юрьевна
С 2022 года
2) Получение и исследование свойств цистеин-богатого белка-антикоагулянта медицинской пиявки
Бровина Ксения Александровна.
С 2024 года
1) Дизайн новых антимикробных пептидов и анализ их структурно-функциональных свойств
Серебренникова Мария Юрьевна
С 2022 года
2) Получение и исследование свойств цистеин-богатого белка-антикоагулянта медицинской пиявки
Бровина Ксения Александровна.
С 2024 года
Патент РФ № 2019145118 «Способ терапиии колректального рака»
Патент РФ № RU2736888 «Штамм «DD1» вируса инфекционной бурсальной болезни кур семейства Birnaviridae, рода Avibirnavirus, 1 серотипа для производства инактивированных сорбированных и эмульгированных вакцин»
Патент РФ № 2694717С2 «Способ получения рекомбинантного белка VP3 вируса инфекционной бурсальной болезни»
Патент РФ № 2520083 «Способ определения активности транскрипционных факторов»
Патент РФ № 2556823 «Способ оценки биоактивности химических соединений»
Патент РФ на изобретение № 2464314 «Способ конденсации плазмидной ДНК для трансфекции эукариотических клеток»
Патент РФ на изобретение № 2468089 «Способ ингибирования возбудителя хламидийной инфекции с использованием генов антимикробных пептидов паука Lachesana tarabaevi»
Патент РФ на изобретение № 2658429 «Рекомбинантная плазмидная ДНК PET15/N-DEST+ и способ ее получения, штамм ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)GOLD, трансформированный рекомбинантной ДНК PET15/N-DEST+, и способ его получения, способ получения рекомбинантного бифункционального фермента - дестабилазы медицинской пиявки»
Патент РФ на изобретение № 2557305 «Штамм ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)GOLD/PETMIN-CYPA - продуцент рекомбинантного циклофилина А человека»
Патент РФ № RU2736888 «Штамм «DD1» вируса инфекционной бурсальной болезни кур семейства Birnaviridae, рода Avibirnavirus, 1 серотипа для производства инактивированных сорбированных и эмульгированных вакцин»
Патент РФ № 2694717С2 «Способ получения рекомбинантного белка VP3 вируса инфекционной бурсальной болезни»
Патент РФ № 2520083 «Способ определения активности транскрипционных факторов»
Патент РФ № 2556823 «Способ оценки биоактивности химических соединений»
Патент РФ на изобретение № 2464314 «Способ конденсации плазмидной ДНК для трансфекции эукариотических клеток»
Патент РФ на изобретение № 2468089 «Способ ингибирования возбудителя хламидийной инфекции с использованием генов антимикробных пептидов паука Lachesana tarabaevi»
Патент РФ на изобретение № 2658429 «Рекомбинантная плазмидная ДНК PET15/N-DEST+ и способ ее получения, штамм ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)GOLD, трансформированный рекомбинантной ДНК PET15/N-DEST+, и способ его получения, способ получения рекомбинантного бифункционального фермента - дестабилазы медицинской пиявки»
Патент РФ на изобретение № 2557305 «Штамм ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)GOLD/PETMIN-CYPA - продуцент рекомбинантного циклофилина А человека»
Грант РНФ № 24-25-00344 «Создание рекомбинантных белков для селективного уничтожения клеток злокачественной меланомы»
Грант РНФ № 23-15-00084 «Разработка новых антимикробных пептидов путем
направленного отбора» 2023-2025 гг.
Завершенные
РНФ№ 23-24-00080 «Генетическая модификация путей синтеза липополисахарида у Escherichia coli для получения продуцентов рекомбинантных белков и плазмид со сниженным содержанием эндотоксинов»
РНФ№23-24-00012 «Получение линии HEK293 - продуцента рекомбинантных белков, культивируемой в минимальных питательных средах, путем CRISPR/Cas9 опосредованного усиления экспрессии генов ростовых факторов»
РНФ №14-14-00696 «Системный анализ секрета слюнных желез медицинских пиявок различных видов (Hirudo medicinalis, H. verbаna, H.orientalis) для направленного поиска новых антимикробных белков и пептидов»
РНФ №20-15-00270 «Исследование взаимодействия катионных пептидов медицинской пиявки с компонентами крови как первый шаг к системному применению антимикробных пептидов для терапии инфекционных заболеваний»
РНФ №23-25-00006 «Исследование свойств новых антикоагулянтов из слюны медицинской пиявки Hirudo medicinalis»
РНФ №17-75-20099 «Новые тромболитические и антикоагуляционные белки и пептиды медицинской пиявки»
РНФ № 16-16-04051 «Конструирование и получение рекомбинантных вирусных антигенов с целью создания диагностикумов и вакцин нового поколения для промышленного птицеводства»
РФФИ №16-34-00480 «Изучение механизма изопептидазной ферментативной активности дестабилазы медицинской пиявки»
РФФИ №16-34-00936 «Поиск новых антимикробных пептидов, активных в отношении внутриклеточных бактерий, и исследование механизмов их действия»
Грант РНФ № 23-15-00084 «Разработка новых антимикробных пептидов путем
направленного отбора» 2023-2025 гг.
Завершенные
РНФ№ 23-24-00080 «Генетическая модификация путей синтеза липополисахарида у Escherichia coli для получения продуцентов рекомбинантных белков и плазмид со сниженным содержанием эндотоксинов»
РНФ№23-24-00012 «Получение линии HEK293 - продуцента рекомбинантных белков, культивируемой в минимальных питательных средах, путем CRISPR/Cas9 опосредованного усиления экспрессии генов ростовых факторов»
РНФ №14-14-00696 «Системный анализ секрета слюнных желез медицинских пиявок различных видов (Hirudo medicinalis, H. verbаna, H.orientalis) для направленного поиска новых антимикробных белков и пептидов»
РНФ №20-15-00270 «Исследование взаимодействия катионных пептидов медицинской пиявки с компонентами крови как первый шаг к системному применению антимикробных пептидов для терапии инфекционных заболеваний»
РНФ №23-25-00006 «Исследование свойств новых антикоагулянтов из слюны медицинской пиявки Hirudo medicinalis»
РНФ №17-75-20099 «Новые тромболитические и антикоагуляционные белки и пептиды медицинской пиявки»
РНФ № 16-16-04051 «Конструирование и получение рекомбинантных вирусных антигенов с целью создания диагностикумов и вакцин нового поколения для промышленного птицеводства»
РФФИ №16-34-00480 «Изучение механизма изопептидазной ферментативной активности дестабилазы медицинской пиявки»
РФФИ №16-34-00936 «Поиск новых антимикробных пептидов, активных в отношении внутриклеточных бактерий, и исследование механизмов их действия»
Приглашаем студентов в лабораторию генной инженерии
Хотите внести вклад в борьбу с глобальными вызовами медицины, такими как антибиотикорезистентность и сердечно-сосудистые заболевания? Присоединяйтесь к нашей команде и участвуйте в интересных проектах!
Направления исследований:
- Поиск и разработка новых антимикробных пептидов (АМП) – коротких полипептидов, способных противодействовать распространению бактерий, устойчивых к традиционным антибиотикам.
- Изучение свойств потенциальных антикоагулянтов, найденных при анализе генома, траснкриптома и пептидома медицинской пиявки (Hirudo medicinalis) и родственных ей видов. Обнаружение новых антикоагулянтов может расширить перечень лекарств для борьбы для борьбы с сердечно-сосудистыми заболеваниями, связанными с тромбообразованием.
- Геномное редактирование – работа как с бактериальными клетками (метаболическая инженерия, получение штаммов-продуцентов для эффективной наработки рекомбинантных белков и пептидов) так и с эукариотическими клетками (создание клеточных моделей заболеваний) с использованием технологии CRISPR-Cas9.
- Модификация клеточных линий путем специфической активации экспрессии генов методом CRISPR-Cas9-SAM. Активация экспрессии генов различных эндогенных ростовых факторов для получения линий клеток с повышенной продуктивностью, растущих на простых питательных средах.
Чему вы научитесь?
- Современным методам молекулярной биологии (ПЦР, клонирование, сайт-направленный мутагенез, трансформация)
- Работе с бактериальными и эукариотическими культурами
- Геномному редактированию (CRISPR-Cas9)
- Селекции и анализу антимикробных пептидов и рекомбинантных белков
- Методам очистки и анализа биомолекул
Кого мы ждем?
Студентов, увлеченных молекулярной биологией, биоинженерией, готовых к сложным, но захватывающим исследованиям. Мы предлагаем реальный лабораторный опыт и возможность участвовать в современных и интересных проектах!
лаборатория нейрорецепторов и нейрорегуляторов
лаборатория функциональной геномики и протеомики растений
лаборатория функциональной геномики и протеомики растений
кафедра физиологии человека и животных
