Лаборатория молекулярной медицины
Лаборатория создана в 2020 году является подразделением Центра молекулярной медицины и диагностики и расположена на территории КБ № 123 (Одинцово, Красногорское шоссе 15). Основные виды исследований в лаборатории это микробиологические, гистологические и иммуногистохимические, масс-спектрометрические, иммунологические и молекулярно-генетические.
Первые проекты лаборатории были посвящены изучению биомаркеров, характеризующих тяжесть течения инфекции, вызванной SARS-CoV-2; влияния инфекционных агентов на особенности ЛОР-патологии, которые были выполнены совместно с врачами наших отделений и ФГБОУВО «Московский государственный медико-стоматологический университет имени А.И. Евдокимова» МЗ РФ.
Фундаментальные научные исследования лаборатории были поддержаны грантом РНФ на тему «Создание новых микрофлюидных биосенсоров для диагностики и типирования туберкулезной инфекции» и грантом президента РФ «Разработка микрофлюидной тест-системы на основе флуорисцентных микросфер для выявления антител к SARS-Cov-2». Оба проекта выполнялись в тесной коллаборации с Центром Технологий и Микрофабрикации.
В дальнейшем интересы лаборатории были сфокусированы на изучении особенностей кишечной микробиоты и способах ее коррекции. На базе ГБУЗ Морозовская ДГКБ ДЗМ был реализован проект «Трансплантация фекальной микробиоты у реципиентов аллогенной трансплантации костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток», поддержанный грантом АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении». На сегодняшний день трансплантация фекальной микробиоты проведена более чем 50 пациентам. Получен патент на изобретение РФ: RU 2809736C2 "Способ получения лиофильно высушенного препарата фекалий человека для трансплантации фекальной микробиоты".
Для поиска маркеров, характеризующих восстановление микробиоты, в лаборатории проведена адаптация метода высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с тандемной масс-спектрометрией для мониторинга содержания желчных кислот и их конъюгатов в организме человека.
В настоящее время лаборатория принимает участие в выполнении масштабных проектов, посвященных изучению резистентности бактерий группы ESKAPE и разработки способов их диагностики, а также поиску биомаркеров для мониторинга состояния здоровья человека в условиях длительного космического полета.
Лаборатория тесно взаимодействует как с другими научными и клиническими подразделениями организациями, так и сторонними коллабораторами.
Сотрудники лаборатории имеют сертификаты повышения квалификации в области клинической лабораторной диагностики. Являются членами ассоциации федерации лабораторной медицины и других профильных сообществ.
На базе лаборатории проходят обучение и выполнение выпускных квалификационных работ студенты РХТУ им. Д.И. Менделеева и МФТИ.
Первые проекты лаборатории были посвящены изучению биомаркеров, характеризующих тяжесть течения инфекции, вызванной SARS-CoV-2; влияния инфекционных агентов на особенности ЛОР-патологии, которые были выполнены совместно с врачами наших отделений и ФГБОУВО «Московский государственный медико-стоматологический университет имени А.И. Евдокимова» МЗ РФ.
Фундаментальные научные исследования лаборатории были поддержаны грантом РНФ на тему «Создание новых микрофлюидных биосенсоров для диагностики и типирования туберкулезной инфекции» и грантом президента РФ «Разработка микрофлюидной тест-системы на основе флуорисцентных микросфер для выявления антител к SARS-Cov-2». Оба проекта выполнялись в тесной коллаборации с Центром Технологий и Микрофабрикации.
В дальнейшем интересы лаборатории были сфокусированы на изучении особенностей кишечной микробиоты и способах ее коррекции. На базе ГБУЗ Морозовская ДГКБ ДЗМ был реализован проект «Трансплантация фекальной микробиоты у реципиентов аллогенной трансплантации костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток», поддержанный грантом АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении». На сегодняшний день трансплантация фекальной микробиоты проведена более чем 50 пациентам. Получен патент на изобретение РФ: RU 2809736C2 "Способ получения лиофильно высушенного препарата фекалий человека для трансплантации фекальной микробиоты".
Для поиска маркеров, характеризующих восстановление микробиоты, в лаборатории проведена адаптация метода высокоэффективной жидкостной хроматографии в сочетании с тандемной масс-спектрометрией для мониторинга содержания желчных кислот и их конъюгатов в организме человека.
В настоящее время лаборатория принимает участие в выполнении масштабных проектов, посвященных изучению резистентности бактерий группы ESKAPE и разработки способов их диагностики, а также поиску биомаркеров для мониторинга состояния здоровья человека в условиях длительного космического полета.
Лаборатория тесно взаимодействует как с другими научными и клиническими подразделениями организациями, так и сторонними коллабораторами.
Сотрудники лаборатории имеют сертификаты повышения квалификации в области клинической лабораторной диагностики. Являются членами ассоциации федерации лабораторной медицины и других профильных сообществ.
На базе лаборатории проходят обучение и выполнение выпускных квалификационных работ студенты РХТУ им. Д.И. Менделеева и МФТИ.
Контакты: centermolmed@gmail.com
Научная биография
Заслуги
В 2016 г. защитила кандидатскую диссертацию по специальности «биохимия» «Геномная и протеомная характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis кластера Beijing B0/W148» в Научно-исследовательском институте биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича.
В 2019 г. стала лауреатом премии Правительства Москвы молодым ученым «за вклад в изучение молекулярных особенностей возбудителя туберкулеза и поиск новых средств эффективной борьбы с инфекцией» по направлению «Медицинские науки».
В 2019 г. стала лауреатом премии Правительства Москвы молодым ученым «за вклад в изучение молекулярных особенностей возбудителя туберкулеза и поиск новых средств эффективной борьбы с инфекцией» по направлению «Медицинские науки».
- В 2021 году присуждена медаль Российской академии наук для молодых ученых в области медицины за цикл работ «Разработка системного подхода к изучению ответа Mycobacterium tuberculosis на противотуберкулезную терапию»
- В 2022 году решением Президиума ФЛМ награждена стипендией имени профессора Блатона
- В 2024 году получила степень магистра по общественному здравоохранению
- Главный внештатный специалист ЦФО ФМБА по клинической микробиологии и антибиотикорезистентности
- Член межрегионального микробиологического общества
- Член ассоциации медицинских микробиологов
- Член Ассоциации Федерации Лабораторной Медицины
- Член Академии EFLM (European Federation of clinical chemistry and Laboratory Medicine)
- Эксперт Фонда поддержки молодых ученых имени Геннадия Комиссарова
- Ведет преподавательскую деятельность в РХТУ им Д.И. Менделеева и МФТИ
Кандидат биологических наук
Заведующая лабораторией
Беспятых Юлия Андреевна
ORCID: 0000-0002-4408-503X
Scopus: 56088750000
ResearcherID: Q-8132-2016
- Молекулярные механизмы устойчивости бактериальных патогенов
- Разработка методов идентификации и типирование патогенов
- Системный подход к изучению сложных комплексных и многофакторных нозологий
- Изучение механизмов эффективности трансплантации фекальной микробиоты
Научные интересы:
Кандидат биологических наук
Старший научный сотрудник
Балаж Ирина Андреевна
ORCID: 0000-0003-2026-3521
Scopus: 57221101437
ResearcherID: HTO-5009-2023
- Член ассоциации специалистов в области молекулярной, клеточной и синтетической биологии
- Член межрегионального Микробиологического Общества
Регалии:
Кандидат биологических наук
Научный сотрудник
Господарик Алина Владимировна
ORCID: 0009-0003-7870-1106
Scopus: 51664999800
- Член национальной ассоциации биобанков и специалистов по биобанкированию
Регалии:
Кандидат биологических наук
Научный сотрудник
Шанский Ярослав Дмитриевич
- Член Ассоциации Федерации Лабораторной Медицины
Регалии:
Также в составе лаборатории:
- Иванов Виктор АндреевичМладший научный сотрудник
- Прохорова Наталья ДмитриевнаМладший научный сотрудник
- Хромых Николай ИвановичЛаборант-исследователь
- Есиев Сулейман СергеевичЛаборант-исследователь, аспирант 2 года РХТУ им. Д.И. Менделеева
- Кудрявцева Юлия ВитальевнаЛаборант-исследователь, аспирант 1 года РХТУ им. Д.И. Менделеева
- Лексина Анастасия ВалерьевнаЛаборант-исследователь, ординатор 2 года КФУ
Избранные публикации в рецензируемых научных журналах
1) The Elaboration of Effective Coatings for Photonic Crystal Chips in Optical Biosensors.
Sizova S, Shakurov R, Mitko T, Shirshikov F, Solovyeva D, Konopsky V, Alieva E, Klinov D, Bespyatykh J, Basmanov D.
Polymers. 2022; 14(1):152
2) Роль генетических маркеров лекарственной устойчивости mef и ermB при подборе доноров фекальной микробиоты
Господарик А.В., Улаханова Л.А., Есиев С.С., Полякова Е.В., Шанский Я.Д., Беспятых Ю.А.
Вестник РГМУ. 2022; (6): 5-12 –.
3) VapC toxin switches M. smegmatis cells into dormancy through 23S rRNA cleavage
Zamakhaev M., Grigorov A., Bespyatykh J., Azhikina T., Goncharenko A., Shumkov M.
Arch Microbiol 205, 28 (2023).
4) Трансплантация фекальной микробиоты при астровирусной инфекции у реципиента аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток: клинический случай
Беспятых Ю.А., Господарик А.В., Журавель Е.А., Серёгин Г.З., Комарова А.В., Есиев С.С., Бронин Г.О., Шанский Я.Д.
Клиническая практика. 2023;14(1):115–122
5) Dendrimer-Based Coatings on a Photonic Crystal Surface for Ultra-Sensitive Small Molecule Detection
Shakurov, R.; Sizova, S.; Dudik, S.; Serkina, A.; Bazhutov, M.; Stanaityte, V.; Tulyagin, P.; Konopsky, V.; Alieva, E.; Sekatskii, S.; Bazhutov M., Stanaityte V., Tulyagin P., Konopsky V., Alieva E., Sekatskii S., Bespyatykh J., Basmanov D.
Polymers 2023, 15, 2607
6) ТБ-ИЗАТЕСТ: способ дифференциальной диагностики Mycobacterium tuberculosis методом LAMP
Ширшиков Ф.В., Беспятых Ю.А.
Биоорганическая химия. 2023. Т. 49. № 6. С. 627-640
7) The Benefits of Toxicity: M. smegmatis VapBC TA Module Is Induced by Tetracycline Exposure and Promotes Survival
Zamakhaev M.; Bespyatykh J.; Goncharenko A.; Shumkov M.
Microorganisms 2023, 11, 2863
8) Evaluation of serum and urine biomarkers for severe COVID-19
Shansky YD, Yanushevich OO, Gospodarik AV, Maev IV, Krikheli NI, Levchenko OV, Zaborovsky AV, Evdokimov VV, Solodov AA, Bely PA, Andreev DN, Serkina AN, Esiev SS, Komarova AV, Sokolov PS, Fomenko AK, Devkota MK, Tsaregorodtsev SV and Bespyatykh JA
Front. Med. 11:1357659. 2024
9) Подбор доноров для трансплантации фекальной микробиоты: невольный скрининг здоровья населения
Господарик А.В., Прохорова Н. Д., Беспятых Ю. А.
ОРГЗДРАВ: новости, мнения, обучения. Вестник ВШОУЗ. 2024. Т. 10. № 1 (35). С. 92-103.
10) Опыт использования технологии трансплантации фекальной микробиоты для лечения кишечного синдрома различной этиологии после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток у детей
Г. З. Серегин, Ю. А. Беспятых, А. В. Господарик, М. Ю. Кириллов, Л. В. Огнева, С. В. Жилина, Е. А. Бурцев, А. Е. Буря, И. О. Власова, М. Р. Журавель, Е. А. Журавель, В. В. Константинова, Б. М. Курманов, А. В. Лифшиц, М. В. Натрусова, А. Е. Донников, М. А. Масчан, Г. О. Бронин
Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии 2024; 23 (2): 98–106
11) Роль миндалин в генезе PFAPA-синдрома: современный взгляд и описание двух клинических случаев
Иванов В. А., Котова Е. Н., Худжадзе Р. Т., Баранов К. К., Есиев С. С., Шанский Я. Д., Вязьменов Э. О., Протасов А. А., Полунин М. М., Беспятых Ю. А.
Медицинский совет. 2024. Т. 18. № 11. С. 298-305
12) Study of the Effect of Electrodeless Radiofrequency Discharge Treatment on Oxygen-Containing Aliphatic Compounds
Lubin, A.A., Yakushin, R.V., Chistolinov, A.V., Perfil’eva, E. S. Osinova, Yu. A. Bespyatykh & Ya. D. Shanskii
High Energy Chem 58 (Suppl 2), S165–S169 (2024)
1) The Elaboration of Effective Coatings for Photonic Crystal Chips in Optical Biosensors.
Sizova S, Shakurov R, Mitko T, Shirshikov F, Solovyeva D, Konopsky V, Alieva E, Klinov D, Bespyatykh J, Basmanov D.
Polymers. 2022; 14(1):152
2) Роль генетических маркеров лекарственной устойчивости mef и ermB при подборе доноров фекальной микробиоты
Господарик А.В., Улаханова Л.А., Есиев С.С., Полякова Е.В., Шанский Я.Д., Беспятых Ю.А.
Вестник РГМУ. 2022; (6): 5-12 –.
3) VapC toxin switches M. smegmatis cells into dormancy through 23S rRNA cleavage
Zamakhaev M., Grigorov A., Bespyatykh J., Azhikina T., Goncharenko A., Shumkov M.
Arch Microbiol 205, 28 (2023).
4) Трансплантация фекальной микробиоты при астровирусной инфекции у реципиента аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток: клинический случай
Беспятых Ю.А., Господарик А.В., Журавель Е.А., Серёгин Г.З., Комарова А.В., Есиев С.С., Бронин Г.О., Шанский Я.Д.
Клиническая практика. 2023;14(1):115–122
5) Dendrimer-Based Coatings on a Photonic Crystal Surface for Ultra-Sensitive Small Molecule Detection
Shakurov, R.; Sizova, S.; Dudik, S.; Serkina, A.; Bazhutov, M.; Stanaityte, V.; Tulyagin, P.; Konopsky, V.; Alieva, E.; Sekatskii, S.; Bazhutov M., Stanaityte V., Tulyagin P., Konopsky V., Alieva E., Sekatskii S., Bespyatykh J., Basmanov D.
Polymers 2023, 15, 2607
6) ТБ-ИЗАТЕСТ: способ дифференциальной диагностики Mycobacterium tuberculosis методом LAMP
Ширшиков Ф.В., Беспятых Ю.А.
Биоорганическая химия. 2023. Т. 49. № 6. С. 627-640
7) The Benefits of Toxicity: M. smegmatis VapBC TA Module Is Induced by Tetracycline Exposure and Promotes Survival
Zamakhaev M.; Bespyatykh J.; Goncharenko A.; Shumkov M.
Microorganisms 2023, 11, 2863
8) Evaluation of serum and urine biomarkers for severe COVID-19
Shansky YD, Yanushevich OO, Gospodarik AV, Maev IV, Krikheli NI, Levchenko OV, Zaborovsky AV, Evdokimov VV, Solodov AA, Bely PA, Andreev DN, Serkina AN, Esiev SS, Komarova AV, Sokolov PS, Fomenko AK, Devkota MK, Tsaregorodtsev SV and Bespyatykh JA
Front. Med. 11:1357659. 2024
9) Подбор доноров для трансплантации фекальной микробиоты: невольный скрининг здоровья населения
Господарик А.В., Прохорова Н. Д., Беспятых Ю. А.
ОРГЗДРАВ: новости, мнения, обучения. Вестник ВШОУЗ. 2024. Т. 10. № 1 (35). С. 92-103.
10) Опыт использования технологии трансплантации фекальной микробиоты для лечения кишечного синдрома различной этиологии после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток у детей
Г. З. Серегин, Ю. А. Беспятых, А. В. Господарик, М. Ю. Кириллов, Л. В. Огнева, С. В. Жилина, Е. А. Бурцев, А. Е. Буря, И. О. Власова, М. Р. Журавель, Е. А. Журавель, В. В. Константинова, Б. М. Курманов, А. В. Лифшиц, М. В. Натрусова, А. Е. Донников, М. А. Масчан, Г. О. Бронин
Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии 2024; 23 (2): 98–106
11) Роль миндалин в генезе PFAPA-синдрома: современный взгляд и описание двух клинических случаев
Иванов В. А., Котова Е. Н., Худжадзе Р. Т., Баранов К. К., Есиев С. С., Шанский Я. Д., Вязьменов Э. О., Протасов А. А., Полунин М. М., Беспятых Ю. А.
Медицинский совет. 2024. Т. 18. № 11. С. 298-305
12) Study of the Effect of Electrodeless Radiofrequency Discharge Treatment on Oxygen-Containing Aliphatic Compounds
Lubin, A.A., Yakushin, R.V., Chistolinov, A.V., Perfil’eva, E. S. Osinova, Yu. A. Bespyatykh & Ya. D. Shanskii
High Energy Chem 58 (Suppl 2), S165–S169 (2024)
Обзоры и монографии
1) Proteogenomic Approach for Mycobacterium tuberculosis Investigation
Bespyatykh J, Arapidi G, Shitikov E.
Methods Mol Biol. 2021;2259:191-201.
2) Омиксные технологии в диагностике Mycobacterium tuberculosis
Ю. А. Беспятых, Д. В. Басманов.
Медицина экстремальных ситуаций, 2022
3) Петлевая изотермическая амплификация: от теории к практике
Ф. В. Ширшиков, Ю. А. Беспятых.
Биоорганическая химия, 2022, том 48, № 6, с. 677–693
4) Bile Acids: Physiological Activity and Perspectives of Using in Clinical and Laboratory Diagnostics
Shansky, Y.; Bespyatykh, J.
Molecules 2022, 27, 7830
5) Микробиота кишечника: роль в здоровье человека и потенциал для персонализированной медицины
Прохорова Н.Д., Господарик А.В., Беспятых Ю.А.
Доказательная гастроэнтерология. 2024;13(4):90–97
6) Перспективные направления мониторинга состояния здоровья человека в условиях длительного космического полета
Иванов В.А., Шанский Я.Д., Прусаков К.А., Беспятых Ю.А., Басманов Д.В.
Медицина экстремальных ситуаций. 2024;26(4):114–122
1) Proteogenomic Approach for Mycobacterium tuberculosis Investigation
Bespyatykh J, Arapidi G, Shitikov E.
Methods Mol Biol. 2021;2259:191-201.
2) Омиксные технологии в диагностике Mycobacterium tuberculosis
Ю. А. Беспятых, Д. В. Басманов.
Медицина экстремальных ситуаций, 2022
3) Петлевая изотермическая амплификация: от теории к практике
Ф. В. Ширшиков, Ю. А. Беспятых.
Биоорганическая химия, 2022, том 48, № 6, с. 677–693
4) Bile Acids: Physiological Activity and Perspectives of Using in Clinical and Laboratory Diagnostics
Shansky, Y.; Bespyatykh, J.
Molecules 2022, 27, 7830
5) Микробиота кишечника: роль в здоровье человека и потенциал для персонализированной медицины
Прохорова Н.Д., Господарик А.В., Беспятых Ю.А.
Доказательная гастроэнтерология. 2024;13(4):90–97
6) Перспективные направления мониторинга состояния здоровья человека в условиях длительного космического полета
Иванов В.А., Шанский Я.Д., Прусаков К.А., Беспятых Ю.А., Басманов Д.В.
Медицина экстремальных ситуаций. 2024;26(4):114–122
Патент на изобретение RU 2809735 C1 «Способ определения бактерии вида Mycobacterium tuberculosis методом петлевой изотермической амплификации (LAMP)». Ширшиков Ф.В., Беспятых Ю.А., 15.12.2023.
Патент на изобретение RU 2809736 C2 «Способ получения лиофильно высушенного препарата фекалий человека для трансплантации фекальной микробиоты». Жгун Е. С., Сорокина Е. А., Кислун Ю. В., Ильина Е.Н., Денисова Е. А., Беспятых Ю. А., 15.12.2023.
Патент на изобретение RU 2809736 C2 «Способ получения лиофильно высушенного препарата фекалий человека для трансплантации фекальной микробиоты». Жгун Е. С., Сорокина Е. А., Кислун Ю. В., Ильина Е.Н., Денисова Е. А., Беспятых Ю. А., 15.12.2023.
Грант АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении» на тему «Таргетирование микробиома желудочно-кишечного тракта реципиентов аллогенных гемопоэтических стволовых клеток для лечения тяжёлых рефрактерных иммунных и инфекционных осложнений»
Контакт на тему «Изучение резистентности клинических изолятов бактерий группы ESKAPE и определение перспективных направлений разработки ее диагностики»
Грант Президента РФ «Разработка микрофлюидной тест-системы на основе флуорисцентных микросфер для выявления антител к SARS-Cov-2»
Грант РНФ «Создание новых микрофлюидных биосенсоров для диагностики и типирования туберкулезной инфекции»
Контакт на тему «Изучение резистентности клинических изолятов бактерий группы ESKAPE и определение перспективных направлений разработки ее диагностики»
Грант Президента РФ «Разработка микрофлюидной тест-системы на основе флуорисцентных микросфер для выявления антител к SARS-Cov-2»
Грант РНФ «Создание новых микрофлюидных биосенсоров для диагностики и типирования туберкулезной инфекции»
